MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C plasmid pO83_CORR

Total Repeats: 2430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017659	TTTG	2	8	2321	2328	0 %	75 %	25 %	0 %	387615191
2	NC_017659	CT	3	6	2338	2343	0 %	50 %	0 %	50 %	387615191
3	NC_017659	TGT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615191
4	NC_017659	GGA	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615191
5	NC_017659	TGG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615191
6	NC_017659	CGC	2	6	2468	2473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615191
7	NC_017659	CCA	2	6	2504	2509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615191
8	NC_017659	A	7	7	2523	2529	100 %	0 %	0 %	0 %	387615191
9	NC_017659	TTC	2	6	2562	2567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615191
10	NC_017659	GAA	2	6	2571	2576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615191
11	NC_017659	TGG	2	6	2590	2595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615191
12	NC_017659	GGC	2	6	2611	2616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615191
13	NC_017659	TCA	2	6	2623	2628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615191
14	NC_017659	GCC	2	6	2664	2669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615191
15	NC_017659	TCG	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615191
16	NC_017659	CAC	2	6	2785	2790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615191
17	NC_017659	CCG	2	6	2817	2822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615191
18	NC_017659	ACG	2	6	2842	2847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615191
19	NC_017659	ATT	2	6	2856	2861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615191
20	NC_017659	TGG	2	6	2907	2912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615191
21	NC_017659	GA	3	6	2913	2918	50 %	0 %	50 %	0 %	387615191
22	NC_017659	CTG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615191
23	NC_017659	ATC	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615191
24	NC_017659	TCAT	2	8	3142	3149	25 %	50 %	0 %	25 %	387615191
25	NC_017659	GTT	2	6	3243	3248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615191
26	NC_017659	CAA	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615191
27	NC_017659	AGC	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615191
28	NC_017659	GGC	2	6	3365	3370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615191
29	NC_017659	T	6	6	3513	3518	0 %	100 %	0 %	0 %	387615192
30	NC_017659	GGA	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615192
31	NC_017659	GC	3	6	3619	3624	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
32	NC_017659	GTG	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615192
33	NC_017659	GCTG	2	8	3687	3694	0 %	25 %	50 %	25 %	387615192
34	NC_017659	CTG	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
35	NC_017659	TGGC	2	8	3763	3770	0 %	25 %	50 %	25 %	387615192
36	NC_017659	T	7	7	3792	3798	0 %	100 %	0 %	0 %	387615192
37	NC_017659	GCA	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
38	NC_017659	TGCGC	2	10	3918	3927	0 %	20 %	40 %	40 %	387615192
39	NC_017659	GCA	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
40	NC_017659	CTG	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
41	NC_017659	TTA	2	6	4017	4022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615192
42	NC_017659	TCG	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
43	NC_017659	CGT	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
44	NC_017659	TG	3	6	4222	4227	0 %	50 %	50 %	0 %	387615192
45	NC_017659	CCA	2	6	4322	4327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615192
46	NC_017659	CTG	2	6	4360	4365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
47	NC_017659	CGG	2	6	4371	4376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
48	NC_017659	GGTC	2	8	4379	4386	0 %	25 %	50 %	25 %	387615192
49	NC_017659	GATC	2	8	4398	4405	25 %	25 %	25 %	25 %	387615192
50	NC_017659	GGA	2	6	4548	4553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615192
51	NC_017659	ACTGGA	2	12	4587	4598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387615192
52	NC_017659	ACC	2	6	4616	4621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615192
53	NC_017659	GACA	2	8	4627	4634	50 %	0 %	25 %	25 %	387615192
54	NC_017659	GC	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
55	NC_017659	GGT	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615192
56	NC_017659	TGC	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
57	NC_017659	TCG	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
58	NC_017659	CGG	2	6	4910	4915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
59	NC_017659	GCT	2	6	4936	4941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
60	NC_017659	CGG	2	6	5019	5024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
61	NC_017659	GAT	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
62	NC_017659	ACC	2	6	5092	5097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615192
63	NC_017659	TGC	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
64	NC_017659	AGCC	2	8	5208	5215	25 %	0 %	25 %	50 %	387615192
65	NC_017659	TGG	2	6	5243	5248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615192
66	NC_017659	GC	3	6	5275	5280	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
67	NC_017659	TGA	2	6	5300	5305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
68	NC_017659	CAG	2	6	5449	5454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
69	NC_017659	GTCAC	2	10	5479	5488	20 %	20 %	20 %	40 %	387615192
70	NC_017659	CGC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615192
71	NC_017659	CTG	2	6	5527	5532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
72	NC_017659	GCA	2	6	5577	5582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
73	NC_017659	ATC	2	6	5620	5625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615192
74	NC_017659	CGC	2	6	5697	5702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615192
75	NC_017659	GCG	2	6	5707	5712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
76	NC_017659	TGC	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
77	NC_017659	CT	3	6	5829	5834	0 %	50 %	0 %	50 %	387615192
78	NC_017659	CCA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615192
79	NC_017659	CGC	2	6	5898	5903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615192
80	NC_017659	CGC	2	6	5986	5991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615192
81	NC_017659	CAG	2	6	6094	6099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
82	NC_017659	GC	3	6	6120	6125	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
83	NC_017659	CCT	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387615192
84	NC_017659	CTGTT	2	10	6224	6233	0 %	60 %	20 %	20 %	387615192
85	NC_017659	CGC	2	6	6252	6257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615192
86	NC_017659	GGC	2	6	6282	6287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
87	NC_017659	TTC	2	6	6289	6294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387615192
88	NC_017659	GCA	2	6	6324	6329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
89	NC_017659	GCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
90	NC_017659	CAGC	2	8	6365	6372	25 %	0 %	25 %	50 %	387615192
91	NC_017659	TGA	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
92	NC_017659	ACT	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615192
93	NC_017659	TCC	2	6	6434	6439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387615192
94	NC_017659	TGA	2	6	6462	6467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
95	NC_017659	GTC	2	6	6550	6555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
96	NC_017659	CACG	2	8	6615	6622	25 %	0 %	25 %	50 %	387615192
97	NC_017659	GAT	2	6	6652	6657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
98	NC_017659	TCG	2	6	6675	6680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
99	NC_017659	TAG	2	6	6717	6722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615192
100	NC_017659	CCA	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615192
101	NC_017659	CGG	2	6	6855	6860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615192
102	NC_017659	CG	3	6	6904	6909	0 %	0 %	50 %	50 %	387615192
103	NC_017659	CTG	2	6	6931	6936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615192
104	NC_017659	CGA	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
105	NC_017659	GAA	2	6	6973	6978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387615192
106	NC_017659	TTG	2	6	7034	7039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615192
107	NC_017659	ACC	2	6	7051	7056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615192
108	NC_017659	GCGG	2	8	7135	7142	0 %	0 %	75 %	25 %	387615192
109	NC_017659	CAG	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615192
110	NC_017659	AGG	2	6	7208	7213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387615192
111	NC_017659	CAA	2	6	7343	7348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615193
112	NC_017659	CAAC	2	8	7375	7382	50 %	0 %	0 %	50 %	387615193
113	NC_017659	GC	3	6	7501	7506	0 %	0 %	50 %	50 %	387615193
114	NC_017659	ATG	2	6	7577	7582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615193
115	NC_017659	GACACT	2	12	7609	7620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387615193
116	NC_017659	GCT	2	6	7654	7659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615193
117	NC_017659	C	7	7	7666	7672	0 %	0 %	0 %	100 %	387615193
118	NC_017659	CGG	2	6	7831	7836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615193
119	NC_017659	TGC	2	6	7947	7952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615193
120	NC_017659	CGC	2	6	8002	8007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387615193
121	NC_017659	ATAA	2	8	8009	8016	75 %	25 %	0 %	0 %	387615193
122	NC_017659	ACA	2	6	8052	8057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615193
123	NC_017659	ATGAAC	2	12	8061	8072	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387615193
124	NC_017659	CGG	2	6	8086	8091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615193
125	NC_017659	GCA	2	6	8094	8099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615193
126	NC_017659	CTG	2	6	8126	8131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615193
127	NC_017659	GAT	2	6	8134	8139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387615193
128	NC_017659	AAC	2	6	8148	8153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615193
129	NC_017659	CGG	2	6	8206	8211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615193
130	NC_017659	TGG	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615193
131	NC_017659	AGAA	2	8	8296	8303	75 %	0 %	25 %	0 %	387615193
132	NC_017659	GTGA	2	8	8345	8352	25 %	25 %	50 %	0 %	387615193
133	NC_017659	CGTA	2	8	8380	8387	25 %	25 %	25 %	25 %	387615193
134	NC_017659	CAG	2	6	8435	8440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615193
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136	NC_017659	TGG	2	6	8513	8518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387615193
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139	NC_017659	TCTT	2	8	8698	8705	0 %	75 %	0 %	25 %	387615194
140	NC_017659	TA	3	6	8901	8906	50 %	50 %	0 %	0 %	387615194
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150	NC_017659	TAC	2	6	9266	9271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615194
151	NC_017659	CGT	2	6	9282	9287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387615194
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153	NC_017659	CGG	2	6	9324	9329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387615194
154	NC_017659	ACC	2	6	9437	9442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387615194
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157	NC_017659	CAG	2	6	9573	9578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387615194
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249	NC_017659	AAT	3	9	15359	15367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615200
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251	NC_017659	AT	3	6	15459	15464	50 %	50 %	0 %	0 %	387615200
252	NC_017659	AT	4	8	15475	15482	50 %	50 %	0 %	0 %	387615200
253	NC_017659	TAT	2	6	15495	15500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387615200
254	NC_017659	AAC	2	6	15511	15516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387615200
255	NC_017659	TGT	2	6	15845	15850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615201
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258	NC_017659	TATATC	2	12	16123	16134	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387615202
259	NC_017659	TATG	2	8	17411	17418	25 %	50 %	25 %	0 %	387615203
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261	NC_017659	AACT	2	8	17451	17458	50 %	25 %	0 %	25 %	387615203
262	NC_017659	GTT	2	6	17533	17538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387615203
263	NC_017659	T	6	6	17544	17549	0 %	100 %	0 %	0 %	387615203
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265	NC_017659	CCGA	2	8	17672	17679	25 %	0 %	25 %	50 %	387615203
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383	NC_017659	AAT	2	6	25150	25155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387615210
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385	NC_017659	TCA	2	6	25259	25264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387615210
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387	NC_017659	GC	3	6	25436	25441	0 %	0 %	50 %	50 %	387615210
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389	NC_017659	TTTC	2	8	25549	25556	0 %	75 %	0 %	25 %	387615211
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